Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLEQ07864 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLEQ07864 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLEQ07864 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLEQ07864 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLEQ07864 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLEQ07864 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLEQ07864 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLEQ07864 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLEQ07864 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLEQ07864 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLEQ07864 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLEQ07864 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLEQ07864 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLEQ07864 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLEQ07864 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLEQ07864 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLEQ07864 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLEQ07864 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLEQ07864 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLEQ07864 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLEQ07864 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLEQ07864 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLEQ07864 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLEQ07864 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLEQ07864 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLEQ07864 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLEQ07864 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLEQ07864 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLEQ07864 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLEQ07864 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLEQ07864 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLEQ07864 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLEQ07864 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLEQ07864 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLEQ07864 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLEQ07864 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLEQ07864 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLEQ07864 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLEQ07864 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLEQ07864 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLEQ07864 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLEQ07864 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLEQ07864 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLEQ07864 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLEQ07864 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLEQ07864 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLEQ07864 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLEQ07864 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLEQ07864 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLEQ07864 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLEQ07864 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLEQ07864 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLEQ07864 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLEQ07864 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLEQ07864 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLEQ07864 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLEQ07864 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLEQ07864 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLEQ07864 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLEQ07864 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLEQ07864 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLEQ07864 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLEQ07864 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLEQ07864 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLEQ07864 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLEQ07864 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLEQ07864 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLEQ07864 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLEQ07864 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLEQ07864 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLEQ07864 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLEQ07864 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLEQ07864 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLEQ07864 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLEQ07864 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLEQ07864 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLEQ07864 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLEQ07864 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLEQ07864 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLEQ07864 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLEQ07864 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLEQ07864 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLEQ07864 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLEQ07864 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms