Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4BQ07343 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE4BQ07343 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4BQ07343 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4BQ07343 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms