Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 KEL3YPL263C 1956 nt8.53□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 SUV3YPL029W 2214 nt8.53□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 DPL1YDR294C 1770 nt8.53□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 snR57snR57 88 nt8.52□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 BUD16YEL029C 939 nt8.52□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 HAP5YOR358W 729 nt8.52□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 TDH1YJL052W 999 nt8.51□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 YKR075CYKR075C 924 nt8.51□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 MRPS8YMR158W 468 nt8.51□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 RAM1YDL090C 1296 nt8.5□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 ECM9YKR004C 1134 nt8.5□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt8.5□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 SSP2YOR242C 1116 nt8.5□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 GPI18YBR004C 1302 nt8.5□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 KRR1YCL059C 951 nt8.49□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 REV7YIL139C 738 nt8.49□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 NAP1YKR048C 1254 nt8.49□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 HEM15YOR176W 1182 nt8.49□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 SFL1YOR140W 2301 nt8.49□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 DTR1YBR180W 1719 nt8.49□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 ERV41YML067C 1059 nt8.48□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 YKR023WYKR023W 1593 nt8.48□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 RRP17YDR412W 708 nt8.47□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 RPN14YGL004C 1254 nt8.47□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 ERP5YHR110W 639 nt8.47□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 MHF1YOL086W-A 273 nt8.47□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 CRC1YOR100C 984 nt8.47□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 SNU71YGR013W 1863 nt8.47□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 MUM3YOR298W 1440 nt8.46□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 MGR3YMR115W 1506 nt8.46□□□□□ -1.05
HDA3Q06623 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt8.46□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YGR066CYGR066C 879 nt8.46□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 SWT21YNL187W 1074 nt8.46□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 MET1YKR069W 1782 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 GTB1YDR221W 2109 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 LEU4YNL104C 1860 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 RTN1YDR233C 888 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 ERG29YMR134W 714 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 TFB4YPR056W 1017 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 AGP3YFL055W 1677 nt8.45□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 GAL2YLR081W 1725 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 OAC1YKL120W 975 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 PHA2YNL316C 1005 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YOL024WYOL024W 519 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 Q0017Q0017 162 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YHL008CYHL008C 1884 nt8.44□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YDL129WYDL129W 876 nt8.43□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 RMD5YDR255C 1266 nt8.43□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 TAF13YML098W 504 nt8.43□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 snR31snR31 225 nt8.43□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 ENO2YHR174W 1314 nt8.43□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 AMF1YOR378W 1548 nt8.43□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 PCP1YGR101W 1041 nt8.42□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 POT1YIL160C 1254 nt8.42□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 VTA1YLR181C 993 nt8.42□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 OST3YOR085W 1053 nt8.42□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 ECM2YBR065C 1095 nt8.42□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 PAU5YFL020C 369 nt8.41□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YKL053WYKL053W 375 nt8.41□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 CTR3YLR411W 726 nt8.41□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 RCE1YMR274C 948 nt8.41□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 MER1YNL210W 813 nt8.41□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 ARO9YHR137W 1542 nt8.4□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 NUR1YDL089W 1455 nt8.4□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 NMT1YLR195C 1368 nt8.4□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 HER2YMR293C 1395 nt8.4□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 INH1YDL181W 258 nt8.4□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 STP3YLR375W 1032 nt8.4□□□□□ -1.06
HDA3Q06623 YCR006CYCR006C 474 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YDL241WYDL241W 372 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 ENT5YDR153C 1236 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YDR467CYDR467C 327 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 TPC1YGR096W 945 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YNL228WYNL228W 777 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 INP54YOL065C 1155 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 DCP1YOL149W 696 nt8.39□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 KGD2YDR148C 1392 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 OKP1YGR179C 1221 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 ATP12YJL180C 978 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 MTQ1YNL063W 945 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 BTS1YPL069C 1008 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 RKM4YDR257C 1485 nt8.38□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 IPI3YNL182C 1668 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 GNP1YDR508C 1992 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 ARO10YDR380W 1908 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YER138W-AYER138W-A 105 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 SNF7YLR025W 723 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 HAT1YPL001W 1125 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 PGC1YPL206C 966 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 ALG5YPL227C 1005 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YHR131CYHR131C 2553 nt8.37□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 MRP7YNL005C 1116 nt8.36□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 BAG7YOR134W 1230 nt8.36□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 YBR232CYBR232C 360 nt8.36□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 NPP2YEL016C 1482 nt8.36□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 DPB2YPR175W 2070 nt8.35□□□□□ -1.07
HDA3Q06623 PCL9YDL179W 915 nt8.35□□□□□ -1.07
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