Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN11Q06124 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN11Q06124 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN11Q06124 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms