Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROM1Q03395 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROM1Q03395 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROM1Q03395 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms