Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLH2Q02577 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NHLH2Q02577 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLH2Q02577 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms