Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 PMT1YDL095W 2454 nt6.84□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 TOP3YLR234W 1971 nt6.83□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 LRO1YNR008W 1986 nt6.83□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.83□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 NDE2YDL085W 1638 nt6.83□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 NDE1YMR145C 1683 nt6.82□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 SGV1YPR161C 1974 nt6.82□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 ADA2YDR448W 1305 nt6.81□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 PDC6YGR087C 1692 nt6.81□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 MEP1YGR121C 1479 nt6.81□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 YIR035CYIR035C 765 nt6.81□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 MFT1YML062C 1179 nt6.81□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 CCR4YAL021C 2514 nt6.81□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 GLY1YEL046C 1164 nt6.8□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 RNA170RNA170 169 nt6.8□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 OLA1YBR025C 1185 nt6.8□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 WSC4YHL028W 1818 nt6.8□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 GDH1YOR375C 1365 nt6.8□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 TIF3YPR163C 1311 nt6.79□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 AFG2YLR397C 2343 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 BEM1YBR200W 1656 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 UTR5YEL035C 501 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 SGF73YGL066W 1974 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 HXT9YJL219W 1704 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 DIP5YPL265W 1827 nt6.78□□□□□ -1.32
SKO1Q02100 BUD31YCR063W 474 nt6.77□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 TAD2YJL035C 753 nt6.77□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 BIM1YER016W 1035 nt6.76□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 BXI1YNL305C 894 nt6.76□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YPR084WYPR084W 1371 nt6.76□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 CMK2YOL016C 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YJR149WYJR149W 1215 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YNL140CYNL140C 570 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YOR300WYOR300W 309 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 RPS6AYPL090C 711 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 RPS6BYBR181C 711 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 SMC5YOL034W 3282 nt6.75□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YJL009WYJL009W 327 nt6.74□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 BUB2YMR055C 921 nt6.74□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YTH1YPR107C 627 nt6.74□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 ATP2YJR121W 1536 nt6.74□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 FRT1YOR324C 1809 nt6.73□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 ELP4YPL101W 1371 nt6.73□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 CHA1YCL064C 1083 nt6.73□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 CRN1YLR429W 1956 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YPT31YER031C 672 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 EDC2YER035W 438 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YHC3YJL059W 1227 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 TGL5YOR081C 2250 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 YER152CYER152C 1332 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 INO1YJL153C 1602 nt6.72□□□□□ -1.33
SKO1Q02100 INM1YHR046C 888 nt6.71□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 YMR206WYMR206W 942 nt6.71□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 YOR268CYOR268C 399 nt6.71□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 YPL264CYPL264C 1062 nt6.71□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 RHO1YPR165W 630 nt6.71□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 PDC5YLR134W 1692 nt6.71□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 TDH1YJL052W 999 nt6.7□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 EHT1YBR177C 1356 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 TPO1YLL028W 1761 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 BAP3YDR046C 1815 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 DAL7YIR031C 1665 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 MAK32YCR019W 1092 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 RMA1YKL132C 1293 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 ADE1YAR015W 921 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 SPE4YLR146C 903 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 KDX1YKL161C 1302 nt6.69□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 HEL1YKR017C 1656 nt6.68□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 YPL277CYPL277C 1464 nt6.68□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 PUP3YER094C 618 nt6.68□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 TDA4YJR116W 840 nt6.68□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 RRT6YGL146C 936 nt6.66□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 TOS1YBR162C 1368 nt6.66□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 KTR4YBR199W 1395 nt6.66□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 NUP53YMR153W 1428 nt6.66□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 THI73YLR004C 1572 nt6.65□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 ARO3YDR035W 1113 nt6.65□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 PMU1YKL128C 888 nt6.65□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 FUS3YBL016W 1062 nt6.65□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 HAL5YJL165C 2568 nt6.65□□□□□ -1.34
SKO1Q02100 ERR3YMR323W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 ERR1YOR393W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 ERR2YPL281C 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 ALG7YBR243C 1347 nt6.65□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 RUP1YOR138C 2016 nt6.65□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 SHC1YER096W 1539 nt6.65□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YKR018CYKR018C 2178 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 YJL043WYJL043W 774 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 KAE1YKR038C 1161 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 ATP10YLR393W 840 nt6.64□□□□□ -1.35
SKO1Q02100 ELP6YMR312W 822 nt6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 804 ms