Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TFAP4Q01664 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFAP4Q01664 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFAP4Q01664 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TFAP4Q01664 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms