Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEFA6Q01524 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEFA6Q01524 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA6Q01524 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms