Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNAQ00169 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNAQ00169 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNAQ00169 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms