Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX1P83916 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX1P83916 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX1P83916 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBX1P83916 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX1P83916 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX1P83916 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBX1P83916 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CBX1P83916 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBX1P83916 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX1P83916 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBX1P83916 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX1P83916 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBX1P83916 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX1P83916 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBX1P83916 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX1P83916 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX1P83916 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX1P83916 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBX1P83916 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBX1P83916 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX1P83916 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBX1P83916 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX1P83916 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX1P83916 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX1P83916 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX1P83916 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX1P83916 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX1P83916 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX1P83916 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX1P83916 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX1P83916 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX1P83916 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX1P83916 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX1P83916 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX1P83916 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX1P83916 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX1P83916 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX1P83916 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX1P83916 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX1P83916 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX1P83916 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX1P83916 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX1P83916 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX1P83916 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX1P83916 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX1P83916 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX1P83916 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX1P83916 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX1P83916 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX1P83916 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX1P83916 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX1P83916 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX1P83916 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX1P83916 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX1P83916 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX1P83916 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX1P83916 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX1P83916 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX1P83916 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX1P83916 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX1P83916 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX1P83916 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX1P83916 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX1P83916 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX1P83916 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX1P83916 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX1P83916 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX1P83916 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX1P83916 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CBX1P83916 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX1P83916 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX1P83916 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX1P83916 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX1P83916 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX1P83916 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX1P83916 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX1P83916 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX1P83916 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX1P83916 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX1P83916 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX1P83916 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX1P83916 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX1P83916 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX1P83916 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX1P83916 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX1P83916 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX1P83916 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms