Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP2P63027 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAMP2P63027 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP2P63027 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms