Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2LP62875 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2LP62875 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2LP62875 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2LP62875 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms