Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS29P62273 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS29P62273 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS29P62273 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS29P62273 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS29P62273 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS29P62273 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS29P62273 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS29P62273 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS29P62273 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS29P62273 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS29P62273 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPS29P62273 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPS29P62273 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPS29P62273 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS29P62273 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS29P62273 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS29P62273 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS29P62273 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS29P62273 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS29P62273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS29P62273 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS29P62273 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS29P62273 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS29P62273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS29P62273 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS29P62273 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS29P62273 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS29P62273 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS29P62273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RPS29P62273 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPS29P62273 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPS29P62273 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPS29P62273 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RPS29P62273 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPS29P62273 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPS29P62273 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPS29P62273 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPS29P62273 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPS29P62273 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPS29P62273 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPS29P62273 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPS29P62273 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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