Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP46P62068 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP46P62068 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP46P62068 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP46P62068 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP46P62068 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP46P62068 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP46P62068 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP46P62068 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP46P62068 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP46P62068 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP46P62068 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP46P62068 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP46P62068 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP46P62068 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP46P62068 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP46P62068 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP46P62068 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP46P62068 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP46P62068 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP46P62068 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP46P62068 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP46P62068 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP46P62068 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP46P62068 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP46P62068 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP46P62068 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP46P62068 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP46P62068 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP46P62068 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP46P62068 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP46P62068 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP46P62068 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP46P62068 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP46P62068 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP46P62068 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP46P62068 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP46P62068 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP46P62068 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP46P62068 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP46P62068 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP46P62068 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP46P62068 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP46P62068 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP46P62068 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP46P62068 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP46P62068 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP46P62068 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP46P62068 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP46P62068 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP46P62068 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP46P62068 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP46P62068 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP46P62068 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP46P62068 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP46P62068 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP46P62068 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP46P62068 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP46P62068 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP46P62068 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP46P62068 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP46P62068 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP46P62068 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP46P62068 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP46P62068 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP46P62068 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP46P62068 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP46P62068 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP46P62068 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP46P62068 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP46P62068 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP46P62068 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP46P62068 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP46P62068 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP46P62068 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP46P62068 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP46P62068 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP46P62068 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP46P62068 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP46P62068 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP46P62068 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms