Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAP25P60880 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAP25P60880 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAP25P60880 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SNAP25P60880 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms