Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTBP60709 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTBP60709 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTBP60709 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTBP60709 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTBP60709 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTBP60709 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTBP60709 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTBP60709 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTBP60709 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTBP60709 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTBP60709 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTBP60709 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTBP60709 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTBP60709 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTBP60709 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTBP60709 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTBP60709 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTBP60709 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTBP60709 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTBP60709 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTBP60709 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTBP60709 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTBP60709 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTBP60709 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTBP60709 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTBP60709 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTBP60709 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTBP60709 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTBP60709 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTBP60709 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTBP60709 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTBP60709 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTBP60709 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTBP60709 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTBP60709 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTBP60709 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTBP60709 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTBP60709 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTBP60709 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTBP60709 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTBP60709 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTBP60709 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTBP60709 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTBP60709 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTBP60709 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTBP60709 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTBP60709 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTBP60709 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTBP60709 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTBP60709 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTBP60709 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTBP60709 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTBP60709 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTBP60709 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTBP60709 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTBP60709 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTBP60709 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTBP60709 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTBP60709 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTBP60709 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTBP60709 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTBP60709 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTBP60709 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTBP60709 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTBP60709 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTBP60709 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTBP60709 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTBP60709 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTBP60709 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTBP60709 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTBP60709 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTBP60709 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTBP60709 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms