Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFRD-1P60508 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms