Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GEMIN4P57678 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEMIN4P57678 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEMIN4P57678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms