Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM33P57088 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM33P57088 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM33P57088 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms