Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN18P56856 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN18P56856 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN18P56856 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms