Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BACE1P56817 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BACE1P56817 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BACE1P56817 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BACE1P56817 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BACE1P56817 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BACE1P56817 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BACE1P56817 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BACE1P56817 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BACE1P56817 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BACE1P56817 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BACE1P56817 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BACE1P56817 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BACE1P56817 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BACE1P56817 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
BACE1P56817 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BACE1P56817 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BACE1P56817 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BACE1P56817 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BACE1P56817 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BACE1P56817 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BACE1P56817 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BACE1P56817 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BACE1P56817 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BACE1P56817 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BACE1P56817 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BACE1P56817 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BACE1P56817 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BACE1P56817 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BACE1P56817 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BACE1P56817 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BACE1P56817 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BACE1P56817 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BACE1P56817 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BACE1P56817 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BACE1P56817 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BACE1P56817 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BACE1P56817 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BACE1P56817 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BACE1P56817 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BACE1P56817 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BACE1P56817 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BACE1P56817 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BACE1P56817 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BACE1P56817 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BACE1P56817 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BACE1P56817 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BACE1P56817 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BACE1P56817 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BACE1P56817 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BACE1P56817 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BACE1P56817 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BACE1P56817 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BACE1P56817 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BACE1P56817 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BACE1P56817 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BACE1P56817 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BACE1P56817 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BACE1P56817 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BACE1P56817 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BACE1P56817 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BACE1P56817 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BACE1P56817 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BACE1P56817 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BACE1P56817 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BACE1P56817 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BACE1P56817 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BACE1P56817 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BACE1P56817 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BACE1P56817 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BACE1P56817 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BACE1P56817 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BACE1P56817 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BACE1P56817 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BACE1P56817 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BACE1P56817 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BACE1P56817 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BACE1P56817 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BACE1P56817 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BACE1P56817 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BACE1P56817 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms