Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN8P56748 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN8P56748 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN8P56748 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN8P56748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms