Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCL23P55773 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCL23P55773 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCL23P55773 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCL23P55773 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL23P55773 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL23P55773 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL23P55773 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL23P55773 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL23P55773 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL23P55773 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCL23P55773 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCL23P55773 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL23P55773 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL23P55773 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCL23P55773 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCL23P55773 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCL23P55773 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCL23P55773 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL23P55773 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL23P55773 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL23P55773 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCL23P55773 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCL23P55773 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCL23P55773 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCL23P55773 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL23P55773 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCL23P55773 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCL23P55773 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCL23P55773 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL23P55773 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL23P55773 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL23P55773 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL23P55773 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL23P55773 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL23P55773 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL23P55773 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL23P55773 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL23P55773 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL23P55773 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCL23P55773 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCL23P55773 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCL23P55773 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCL23P55773 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL23P55773 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL23P55773 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL23P55773 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL23P55773 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL23P55773 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCL23P55773 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCL23P55773 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCL23P55773 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCL23P55773 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCL23P55773 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCL23P55773 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCL23P55773 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCL23P55773 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCL23P55773 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCL23P55773 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCL23P55773 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCL23P55773 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCL23P55773 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCL23P55773 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCL23P55773 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCL23P55773 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL23P55773 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL23P55773 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL23P55773 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL23P55773 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL23P55773 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCL23P55773 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCL23P55773 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCL23P55773 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCL23P55773 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCL23P55773 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCL23P55773 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCL23P55773 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCL23P55773 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCL23P55773 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCL23P55773 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCL23P55773 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCL23P55773 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCL23P55773 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCL23P55773 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCL23P55773 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms