Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCPP55072 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCPP55072 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCPP55072 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCPP55072 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCPP55072 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCPP55072 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCPP55072 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCPP55072 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCPP55072 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VCPP55072 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCPP55072 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCPP55072 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VCPP55072 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCPP55072 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCPP55072 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCPP55072 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCPP55072 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCPP55072 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPP55072 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPP55072 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPP55072 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPP55072 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPP55072 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPP55072 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPP55072 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCPP55072 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCPP55072 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPP55072 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPP55072 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPP55072 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPP55072 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPP55072 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPP55072 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPP55072 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPP55072 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPP55072 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPP55072 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPP55072 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCPP55072 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCPP55072 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCPP55072 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPP55072 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPP55072 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPP55072 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPP55072 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPP55072 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPP55072 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCPP55072 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCPP55072 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPP55072 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPP55072 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VCPP55072 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPP55072 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPP55072 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPP55072 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPP55072 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCPP55072 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCPP55072 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCPP55072 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCPP55072 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCPP55072 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCPP55072 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCPP55072 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VCPP55072 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCPP55072 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCPP55072 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPP55072 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPP55072 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPP55072 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPP55072 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPP55072 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPP55072 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VCPP55072 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPP55072 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPP55072 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPP55072 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPP55072 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPP55072 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCPP55072 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCPP55072 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCPP55072 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPP55072 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPP55072 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPP55072 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPP55072 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPP55072 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPP55072 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPP55072 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPP55072 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPP55072 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCPP55072 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCPP55072 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
VCPP55072 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms