Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA2D1P54289 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D1P54289 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D1P54289 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D1P54289 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms