Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATXN1P54253 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN1P54253 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN1P54253 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN1P54253 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms