Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA8P53708 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA8P53708 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA8P53708 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms