Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPAP53621 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPAP53621 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COPAP53621 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPAP53621 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPAP53621 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPAP53621 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPAP53621 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPAP53621 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPAP53621 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPAP53621 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPAP53621 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPAP53621 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPAP53621 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPAP53621 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPAP53621 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPAP53621 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPAP53621 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPAP53621 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPAP53621 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPAP53621 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPAP53621 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPAP53621 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPAP53621 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPAP53621 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPAP53621 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPAP53621 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPAP53621 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPAP53621 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPAP53621 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPAP53621 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPAP53621 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPAP53621 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPAP53621 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPAP53621 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPAP53621 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPAP53621 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPAP53621 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPAP53621 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPAP53621 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPAP53621 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPAP53621 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPAP53621 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPAP53621 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPAP53621 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPAP53621 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPAP53621 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPAP53621 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPAP53621 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPAP53621 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPAP53621 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPAP53621 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPAP53621 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPAP53621 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPAP53621 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPAP53621 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPAP53621 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPAP53621 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPAP53621 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPAP53621 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPAP53621 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPAP53621 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPAP53621 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPAP53621 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COPAP53621 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPAP53621 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPAP53621 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPAP53621 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms