Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFIP2P53365 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFIP2P53365 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP2P53365 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP2P53365 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms