Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 ANKRD12-207ENST00000581635 631 ntTSL 417.44■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.775e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.665e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.455e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-213ENST00000486942 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.225e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-220ENST00000531061 530 ntTSL 412.68□□□□□ -0.385e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-219ENST00000528603 779 ntTSL 411.91□□□□□ -0.55e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-224ENST00000533825 565 ntTSL 411.17□□□□□ -0.625e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-210ENST00000475697 3375 ntTSL 29.2□□□□□ -0.945e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 OSBPL9-221ENST00000531819 4520 ntTSL 26.14□□□□□ -1.435e-15■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.682e-10■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 DPH7-210ENST00000479650 1797 ntTSL 527.58■■■□□ 2.012e-10■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 DPH7-203ENST00000467243 1311 ntTSL 1 (best)23.48■■□□□ 1.352e-10■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 DPH7-214ENST00000497237 861 ntTSL 515.58■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 KCTD3-203ENST00000452413 589 ntTSL 315.27■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 TNRC18-207ENST00000440081 757 ntTSL 318.12■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 424.19■■□□□ 1.469e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.859e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.719e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 314.26□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 513.79□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 212.29□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.189e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.459e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.69e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.649e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.649e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.659e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.699e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.799e-7■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 TET3-204ENST00000496886 710 ntTSL 323.51■■□□□ 1.351e-10■■■■■ 38.4
HNRNPMP52272 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-23■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 217.2■□□□□ 0.347e-23■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-211ENST00000490200 563 ntTSL 430.44■■■□□ 2.464e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-204ENST00000440042 552 ntTSL 330.31■■■□□ 2.444e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-206ENST00000461711 528 ntTSL 427.8■■■□□ 2.044e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-205ENST00000457954 647 ntTSL 418.48■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-212ENST00000495601 611 ntTSL 216.63■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ORC4-203ENST00000416719 571 ntTSL 34.34□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.85e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 DGCR8-210ENST00000498171 3661 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 38.3
HNRNPMP52272 ARID1A-212ENST00000636219 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 434.99■■■■□ 3.192e-7■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 430.51■■■□□ 2.472e-7■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)31.45■■■□□ 2.623e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 230.54■■■□□ 2.483e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)30.38■■■□□ 2.453e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 230.36■■■□□ 2.453e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.423e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 230.1■■■□□ 2.413e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.143e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.023e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.943e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.943e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.923e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.843e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.833e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.83e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.773e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.543e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.383e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.173e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 TRMU-216ENST00000491612 2933 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 MSH3-201ENST00000265081 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 NUDCD1-203ENST00000519607 2286 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.543e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 NUDCD1-204ENST00000521439 1172 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.623e-11■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.555e-9■■■■■ 38.2
HNRNPMP52272 L3MBTL1-213ENST00000471977 318 ntTSL 315.51■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 L3MBTL1-205ENST00000422861 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.86□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 HNRNPM-212ENST00000598999 409 ntTSL 226.67■■□□□ 1.865e-15■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.417e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 222.4■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 216.71■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 38.1
HNRNPMP52272 CLK3-225ENST00000569063 833 ntTSL 532.16■■■□□ 2.744e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-221ENST00000568139 918 ntTSL 528.64■■■□□ 2.184e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.094e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-217ENST00000566126 732 ntTSL 527.85■■■□□ 2.054e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-223ENST00000568488 481 ntTSL 326.7■■□□□ 1.864e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-211ENST00000563297 526 ntTSL 425.38■■□□□ 1.654e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-204ENST00000483723 1749 ntTSL 220.59■□□□□ 0.894e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-224ENST00000568605 1047 ntTSL 220.21■□□□□ 0.834e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-203ENST00000454830 3787 ntTSL 519.5■□□□□ 0.714e-10■■■■■ 38
HNRNPMP52272 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 38
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 204.6 ms