Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA3P51805 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA3P51805 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNA3P51805 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA3P51805 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms