Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLCN5P51795 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCN5P51795 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN5P51795 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN5P51795 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN5P51795 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms