Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP11P51784 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP11P51784 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP11P51784 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP11P51784 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP11P51784 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP11P51784 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP11P51784 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP11P51784 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP11P51784 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP11P51784 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP11P51784 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP11P51784 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP11P51784 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP11P51784 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP11P51784 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP11P51784 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP11P51784 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP11P51784 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP11P51784 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP11P51784 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP11P51784 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP11P51784 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP11P51784 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP11P51784 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP11P51784 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP11P51784 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP11P51784 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP11P51784 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP11P51784 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP11P51784 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP11P51784 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP11P51784 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP11P51784 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP11P51784 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP11P51784 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP11P51784 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP11P51784 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP11P51784 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP11P51784 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP11P51784 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP11P51784 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP11P51784 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP11P51784 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP11P51784 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP11P51784 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP11P51784 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP11P51784 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP11P51784 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP11P51784 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP11P51784 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP11P51784 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP11P51784 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP11P51784 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP11P51784 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP11P51784 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP11P51784 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP11P51784 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP11P51784 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP11P51784 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP11P51784 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP11P51784 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP11P51784 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP11P51784 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP11P51784 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP11P51784 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP11P51784 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP11P51784 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP11P51784 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP11P51784 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP11P51784 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP11P51784 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP11P51784 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP11P51784 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP11P51784 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP11P51784 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP11P51784 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP11P51784 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP11P51784 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP11P51784 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP11P51784 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP11P51784 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP11P51784 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP11P51784 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP11P51784 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms