Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR5P51681 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR5P51681 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR5P51681 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR5P51681 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR5P51681 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR5P51681 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR5P51681 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR5P51681 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR5P51681 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR5P51681 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR5P51681 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR5P51681 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR5P51681 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR5P51681 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR5P51681 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR5P51681 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR5P51681 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR5P51681 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR5P51681 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR5P51681 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR5P51681 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR5P51681 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR5P51681 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR5P51681 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR5P51681 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR5P51681 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR5P51681 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR5P51681 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR5P51681 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR5P51681 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR5P51681 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR5P51681 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR5P51681 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR5P51681 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR5P51681 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR5P51681 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR5P51681 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR5P51681 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR5P51681 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR5P51681 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR5P51681 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR5P51681 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR5P51681 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR5P51681 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR5P51681 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR5P51681 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR5P51681 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR5P51681 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR5P51681 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR5P51681 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR5P51681 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR5P51681 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR5P51681 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR5P51681 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR5P51681 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR5P51681 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR5P51681 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR5P51681 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR5P51681 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR5P51681 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR5P51681 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR5P51681 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR5P51681 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR5P51681 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR5P51681 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR5P51681 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR5P51681 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR5P51681 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR5P51681 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR5P51681 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR5P51681 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR5P51681 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR5P51681 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR5P51681 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR5P51681 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR5P51681 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR5P51681 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR5P51681 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR5P51681 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR5P51681 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR5P51681 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR5P51681 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR5P51681 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR5P51681 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR5P51681 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR5P51681 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR5P51681 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR5P51681 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR5P51681 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR5P51681 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR5P51681 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR5P51681 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms