Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HCFC1P51610 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCFC1P51610 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCFC1P51610 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1P51610 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms