Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.08
SMARCA4P51532 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
SMARCA4P51532 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
SMARCA4P51532 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA4P51532 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC46.5■■■■■ 5.04
SMARCA4P51532 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA4P51532 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.43■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC46.38■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC46.38■■■■■ 5.02
SMARCA4P51532 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC46.38■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC46.37■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
SMARCA4P51532 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
SMARCA4P51532 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5
SMARCA4P51532 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms