Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOVA1P51513 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NOVA1P51513 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms