Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRIP1P48552 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRIP1P48552 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRIP1P48552 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRIP1P48552 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms