Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA8P48165 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA8P48165 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA8P48165 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA8P48165 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA8P48165 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA8P48165 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA8P48165 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA8P48165 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA8P48165 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA8P48165 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA8P48165 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA8P48165 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA8P48165 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA8P48165 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA8P48165 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA8P48165 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA8P48165 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA8P48165 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA8P48165 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA8P48165 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA8P48165 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA8P48165 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA8P48165 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA8P48165 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA8P48165 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA8P48165 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA8P48165 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA8P48165 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA8P48165 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA8P48165 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA8P48165 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA8P48165 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA8P48165 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA8P48165 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA8P48165 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA8P48165 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA8P48165 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA8P48165 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA8P48165 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA8P48165 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA8P48165 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA8P48165 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA8P48165 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA8P48165 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA8P48165 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA8P48165 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA8P48165 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA8P48165 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA8P48165 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA8P48165 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA8P48165 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA8P48165 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA8P48165 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA8P48165 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA8P48165 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA8P48165 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA8P48165 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA8P48165 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA8P48165 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA8P48165 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA8P48165 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA8P48165 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA8P48165 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA8P48165 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA8P48165 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA8P48165 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA8P48165 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA8P48165 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA8P48165 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA8P48165 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA8P48165 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA8P48165 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA8P48165 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA8P48165 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA8P48165 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA8P48165 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA8P48165 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA8P48165 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA8P48165 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA8P48165 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA8P48165 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA8P48165 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA8P48165 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA8P48165 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA8P48165 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA8P48165 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA8P48165 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA8P48165 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA8P48165 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA8P48165 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA8P48165 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA8P48165 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA8P48165 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms