Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA2P47869 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA2P47869 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA2P47869 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA2P47869 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA2P47869 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA2P47869 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA2P47869 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA2P47869 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA2P47869 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA2P47869 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA2P47869 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA2P47869 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA2P47869 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA2P47869 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA2P47869 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA2P47869 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA2P47869 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA2P47869 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA2P47869 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA2P47869 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA2P47869 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA2P47869 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA2P47869 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA2P47869 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA2P47869 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA2P47869 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA2P47869 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms