Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 AP3S2-206ENST00000558806 578 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-209ENST00000559162 357 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-203ENST00000557999 578 ntTSL 48.93□□□□□ -0.982e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-208ENST00000558999 653 ntTSL 58.39□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-204ENST00000502448 1760 ntTSL 1 (best)5.38□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PCCA-214ENST00000637358 1533 ntTSL 55.31□□□□□ -1.562e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 TTC21B-205ENST00000484129 484 ntTSL 34.42□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-207ENST00000508115 654 ntTSL 54.28□□□□□ -1.722e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 MYH10-208ENST00000472728 383 ntTSL 32.91□□□□□ -1.942e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 XRN1-210ENST00000472697 2652 ntTSL 22.62□□□□□ -1.992e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.789e-7■■■■■ 33.7
MATR3P43243 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.389e-7■■■■■ 33.7
MATR3P43243 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 33.7
MATR3P43243 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 33.7
MATR3P43243 KDM1A-204ENST00000481879 525 ntTSL 32.13□□□□□ -2.077e-9■■■■■ 33.7
MATR3P43243 MTSS1-208ENST00000519671 345 ntTSL 412.06□□□□□ -0.483e-12■■■■■ 33.5
MATR3P43243 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 33.5
MATR3P43243 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 33.5
MATR3P43243 GRAP2-203ENST00000420971 568 ntTSL 27.91□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 33.5
MATR3P43243 GRAP2-206ENST00000478445 583 ntTSL 46.93□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 33.5
MATR3P43243 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.198e-10■■■■■ 33.3
MATR3P43243 BTAF1-202ENST00000471217 2003 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.298e-10■■■■■ 33.3
MATR3P43243 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.648e-10■■■■■ 33.3
MATR3P43243 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 33.3
MATR3P43243 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.763e-9■■■■■ 33.3
MATR3P43243 XRN1-214ENST00000498077 5600 ntTSL 51.94□□□□□ -2.13e-9■■■■■ 33.3
MATR3P43243 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 33.2
MATR3P43243 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 33.2
MATR3P43243 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.991e-7■■■■■ 33.2
MATR3P43243 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 33.2
MATR3P43243 AFF1-208ENST00000511722 638 ntTSL 419.74■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 33.1
MATR3P43243 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 33.1
MATR3P43243 AFF1-210ENST00000514970 582 ntTSL 310.89□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 33.1
MATR3P43243 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -17e-7■■■■■ 33.1
MATR3P43243 TP53BP2-205ENST00000465119 465 ntTSL 524.84■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 33.1
MATR3P43243 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 33.1
MATR3P43243 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 33.1
MATR3P43243 TP53BP2-206ENST00000472180 467 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 33.1
MATR3P43243 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.554e-9■■■■■ 33.1
MATR3P43243 INTS6L-203ENST00000481908 3528 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 33
MATR3P43243 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 33
MATR3P43243 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 33
MATR3P43243 INTS6L-204ENST00000493637 6710 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 33
MATR3P43243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.624e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.54e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-215ENST00000592776 772 ntTSL 524.05■■□□□ 1.444e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.354e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.84e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 CCSAP-204ENST00000483092 3492 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 DOCK4-212ENST00000476846 3218 ntTSL 516.43■□□□□ 0.226e-8■■■■■ 32.8
MATR3P43243 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-17■■■■■ 32.8
MATR3P43243 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-207ENST00000589086 549 ntTSL 415.38■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 SETD4-215ENST00000481477 2761 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-201ENST00000309660 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 SETD4-217ENST00000487297 3358 ntTSL 211.53□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-203ENST00000353319 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-208ENST00000589216 646 ntTSL 310.78□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-210ENST00000591115 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 EPB41L2-213ENST00000526782 424 ntTSL 210.51□□□□□ -0.734e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 EPB41L2-206ENST00000452150 2994 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.212e-17■■■■■ 32.8
MATR3P43243 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.254e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 GOLGB1-205ENST00000482512 10295 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 EPB41L2-202ENST00000368126 715 ntTSL 26.38□□□□□ -1.394e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-214ENST00000592059 577 ntTSL 45.83□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 GOLGB1-208ENST00000494517 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 GOLGB1-206ENST00000489400 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 24.61□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 PTPN2-211ENST00000591305 876 ntTSL 33.83□□□□□ -1.84e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 XRN1-209ENST00000472625 420 ntTSL 53.78□□□□□ -1.84e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 SETD4-214ENST00000469482 702 ntTSL 33.42□□□□□ -1.864e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.974e-9■■■■■ 32.8
MATR3P43243 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.18e-7■■■■■ 32.8
MATR3P43243 AGPAT5-203ENST00000523234 2525 ntTSL 514.32□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 32.8
MATR3P43243 AGPAT5-202ENST00000518327 852 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 32.8
MATR3P43243 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-18■■■■■ 32.7
MATR3P43243 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 32.7
MATR3P43243 ZZZ3-210ENST00000476275 4737 ntTSL 26.15□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 32.7
MATR3P43243 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 32.7
MATR3P43243 ZZZ3-211ENST00000481346 4500 ntTSL 1 (best)3.85□□□□□ -1.795e-7■■■■■ 32.7
MATR3P43243 IMMP1L-214ENST00000533921 122 ntTSL 313.91□□□□□ -0.189e-8■■■■■ 32.6
MATR3P43243 IMMP1L-211ENST00000532668 735 ntTSL 312.72□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 32.6
MATR3P43243 TBL1XR1-227ENST00000636478 100 ntTSL 50.88□□□□□ -2.279e-10■■■■■ 32.6
MATR3P43243 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.838e-7■■■■■ 32.6
MATR3P43243 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 32.6
MATR3P43243 RNF217-206ENST00000454842 545 ntTSL 45.38□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 32.6
MATR3P43243 RNF217-207ENST00000519565 10660 ntTSL 54.9□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 32.6
MATR3P43243 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)28.89■■■□□ 2.228e-7■■■■■ 32.6
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