Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER3P43115 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGER3P43115 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGER3P43115 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGER3P43115 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms