Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRPPRCP42704 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
LRPPRCP42704 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
LRPPRCP42704 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRPPRCP42704 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
LRPPRCP42704 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms