Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM23P36406 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM23P36406 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM23P36406 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM23P36406 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM23P36406 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms