Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMGCLP35914 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGCLP35914 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGCLP35914 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGCLP35914 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGCLP35914 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms