Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX6P35712 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX6P35712 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX6P35712 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX6P35712 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX6P35712 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX6P35712 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX6P35712 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX6P35712 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX6P35712 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX6P35712 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX6P35712 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX6P35712 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX6P35712 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX6P35712 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX6P35712 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX6P35712 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX6P35712 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX6P35712 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX6P35712 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX6P35712 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX6P35712 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX6P35712 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX6P35712 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX6P35712 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX6P35712 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX6P35712 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX6P35712 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX6P35712 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX6P35712 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX6P35712 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX6P35712 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX6P35712 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX6P35712 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX6P35712 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX6P35712 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX6P35712 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX6P35712 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX6P35712 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX6P35712 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX6P35712 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX6P35712 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX6P35712 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX6P35712 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX6P35712 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX6P35712 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX6P35712 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX6P35712 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX6P35712 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX6P35712 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX6P35712 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX6P35712 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX6P35712 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX6P35712 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX6P35712 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX6P35712 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX6P35712 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX6P35712 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX6P35712 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX6P35712 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX6P35712 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX6P35712 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX6P35712 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX6P35712 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX6P35712 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX6P35712 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX6P35712 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX6P35712 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX6P35712 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX6P35712 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX6P35712 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX6P35712 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX6P35712 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX6P35712 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms