Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC8A1P32418 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC8A1P32418 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC8A1P32418 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8A1P32418 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms