Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA6P31267 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
HOXA6P31267 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA6P31267 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms