Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBMS1P29558 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBMS1P29558 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBMS1P29558 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBMS1P29558 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms